Kabupaten Alor
- Pulau Alor
- Pulau Pantar
- Pulau Pura
- Pulau Retta
- Pulau Buaya
- Pulau Nuhabeng
- Pulau Ternate
- Pulau Treweng
- Pulau Batang
- Pulau Lapang
- Pulau Marisa
- Pulau Rusa
- Pulau Kambing
Kabupaten Kupang
- Pulau Semau
- Pulau Tikus
- Pulau Burung
- Pulau Tabui
- Pulau Kambing
- Pulau Kera
- Pulau Sabu
- Pulau Raijua
- Pulau Ndana Sabu
- Pulau Batek
Kabupaten Rote
- Pulau Rote
- Pulau Ndao
- Pulau Nuse
- Pulau Doo
- Pulau Kodi
- Pulau Dao
- Pulau Ndana
- Pulau Landu
- Pulau Nusa Manuk
- Pulau Helihana
- Pulau Bibi
- Pulau Lai
- Pulau Liu
- Pulau Ingguhun
Kabupaten Flores Timur
- Pulau Solor
- Pulau Adonara
- Pulau Konga
- Pulau Suanggi
- Pulau Besar
- Pulau Kambing
Kabupaten Sikka
- Pulau Palue
- Pulau Babi
- Pulau Pangabatan
- Pulau Damhila
- Pulau Permaan
- Pulau Besar
- Pulau Pemana Besar
- Pulau Pemana Kecil
Kabupaten Ende
- Pulau Ende
- Pulau Sanga
- Pulau Koa
Kabupaten Ngada
- Pulau Mborong
- Pulau Dua
- Pulau Ontoloe
- Pulau Gong
- Pulau Lainjawa
- Pulau Nelo
- Pulau Bobajie
- Pulau Pata
- Pulau Bakau
- Pulau Rutong
- Pulau Sui
- Pulau Tembang
- Pulau Tiga
- Pulau Taor
- Pulau Tembaga
- Pulau Wire
- Pulau Batu
Kabupaten Manggarai Barat
- Pulau Mules
- Pulau Longos
- Pulau Komodo
- Pulau Gilibodo
- Pulau Langka
- Pulau Tala
- Pulau Logo
- Pulau Punya
- Pulau Kelor
- Pulau Gilibugis
- Pulau Gililawa Darat
- Pulau Gililawa Laut
- Pulau Kecil
- Pulau Besar
- Pulau Pilar
- Pulau Serai
- Pulau Kode
- Pulau Rinca
- Pulau Gilimotang
- Pulau Baleh
- Pulau Muang
- Pulau Nusarohbong
- Pulau Wainelu
- Pulau Pengah Kecil
- Pulau Pengah Besar
- Pulau Papagaran Besar
- Pulau Papagaran Kecil
- Pulau Pungu Besar
- Pulau Pungu Kecil
- Pulau Mangiatan
- Pulau Tatawa
- Pulau Siaba Besar
- Pulau Sebayur Besar
- Pulau Sebayur Kecil
- Pulau Suleman
- Pulau Kanawa
- Pulau Situri
- Pulau Bajo
- Pulau Kelapa
- Pulau Tobolon
- Pulau Kukusan
- Pulau Seraja Besar
- Pulau Seraja kecil
- Pulau Sebolan Besar
- Pulau Sebolan Kecil
- Pulau Bidadari
Kabupaten Sumba Timur
- Pulau Haluru
- Pulau Koatak
- Pulau Mangkudu
Sumber : Data Base dan Informasi DAS di Wilayah BP DAS Benain-Noelmina Propinsi NTT Tahun 2005. Disusun Balai Pengelola DAS Benain-Noelmina kerjasama dengan Pusat Penelitian Lingkungan Hidup dan Sumberdaya Alam Universitas Nusa Cendana, dan berbagai sumber lainnya.
Data lain